PearTree
PearTree ontwikkelt een cross-platform viewer voor fylogenetische bomen voor genomische epidemiologie, waarbij alle data lokaal op de machine van de gebruiker worden verwerkt.
PearTree ontwikkelt een in de browser draaiende viewer voor fylogenetische bomen, bedoeld voor het verkennen en annoteren van evolutionaire bomen in de genomische epidemiologie. De software is de opvolger van FigTree en is herschreven om volledig in de browser te draaien of als native desktopapplicatie op macOS, Windows en Linux. Grote NEXUS- en Newick-bestanden worden weergegeven met uitgebreide visuele annotaties.
Alle verwerking vindt plaats op de machine van de gebruiker; er worden geen data naar een server geüpload. Dat uitgangspunt van lokale verwerking staat centraal in de aanpak van het bedrijf en is relevant voor onderzoekers die met gevoelige genoomdata werken.
Het bedrijf werkt met een klein team van ontwikkelaars. De technische domeinen omvatten fylogenetica, bio-informatica, datavisualisatie, cross-platform desktopontwikkeling, open source software en peer-to-peer softwareontwikkeling. De software wordt ingezet in de genomische epidemiologie, de bio-informatica, de evolutionaire biologie en het life sciences-onderzoek.
